Experimental evolution of adaptive divergence in fission yeast – 7 avril 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Sergio Tusso, Bart P. S. Nieuwenhuis, Bernadette Weissensteiner, Simone Immler and Jochen B. W. Wolf 2021

Experimental evolution of adaptive divergence under varying degrees of gene flow

Responsable de la discussion :  Carla Bautista Rodríguez du Landry Lab

Mercredi 7 avril à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1038/s41559-020-01363-2

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Generating antibiotic resistance determinants de novo – 24 mars 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Michael Knopp, Arianne M. Babina, Jónína S. Gudmundsdóttir, Martin V. Douglass, M. Stephen Trent, Dan I. Andersson 2021

A novel type of colistin resistance genes selected from random sequence space

Responsable de la discussion :  Johan Hallin du Landry Lab

Mercredi 24 mars à 11h30, TEAMS

https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1009227

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Predicting expression divergence using 1000 yeast – 10 mars 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Dhaval Vaishnav, Carl G. de Boer, Moran Yassour, Jennifer Molinet, Lin Fan, Xian Adiconis, Dawn A. Thompson, Francisco A. Cubillos, Joshua Z. Levin, Aviv Regev 2021

A comprehensive fitness landscape model reveals the evolutionary history and future evolvability of eukaryotic cis-regulatory DNA sequences

Responsable de la discussion :  Simon Aubé du Landry Lab

Mercredi 10 mars à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1101/2021.02.17.430503

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Interfaces accumulate mutations which are deleterious in monomers – 24 février 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Hochberg GKA, Liu Y, Marklund EG, Metzger BPH, Laganowsky A & Thornton JW 2020

A hydrophobic ratchet entrenches molecular complexes

Responsable de la discussion :  Angel Cisneros du Landry Lab

Mercredi 24 février à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1038/s41586-020-3021-2

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The uses of structural protein readouts – 1 février 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Valentina Cappelletti, Thomas Hauser, Ilaria Piazza, … , Paola Picotti 2020

Dynamic 3D proteomes reveal protein functional alterations at high resolution in situ

Responsable de la discussion :  David Bradley du Landry Lab

Mercredi 10 février à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.12.021

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Can enhancers facilitate evolution of de novo genes? – 27 janvier 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Paco Majic and Joshua L Payne 2019

Enhancers Facilitate the Birth of De Novo Genes and Gene Integration into Regulatory Networks

Responsable de la discussion :  Alicia Pageau du Landry Lab

Mercredi 27 janvier à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1093/molbev/msz300

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Adaptive evolution of nontransitive fitness in yeast – 13 Janvier 2021

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Sean W Buskirk, Alecia B Rokes, Gregory I Lang 2020

Adaptive evolution of nontransitive fitness in yeast

Responsable de la discussion :  Damien Biot-Pelletier du Landry Lab

Mercredi 13 janvier à 11h30, TEAMS

https://elifesciences.org/articles/62238

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Can directional selection drive evolvability? – 16 Decembre 2020

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Zheng J, Guo N & Wagner A 2020

Selection enhances protein evolvability by increasing mutational robustness and foldability

Responsable de la discussion :  Diana Ascencio du Landry Lab

Mercredi 16 decembre à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1126/science.abb5962

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Introns: junk or not junk? – 2 Decembre 2020

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Parenteau J, Elela SA 2019

Introns: Good Day Junk Is Bad Day Treasure

Responsable de la discussion :  Marika Drouin du Landry Lab

Mercredi 2 decembre à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1016/j.tig.2019.09.010

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Gene loss can enhance yeast capacity to evolve and adapt – 18 Novembre 2020

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Helsen J, Voordeckers K, Vanderwaeren L, Santermans T, Tsontaki M, Verstrepen KJ,
Jelier R

Gene Loss Predictably Drives Evolutionary Adaptation

Responsable de la discussion :  Anna Fijarczyk du Landry Lab

Mercredi 18 novembre à 11h30, TEAMS

https://doi.org/10.1093/molbev/msaa172

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