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- Experimental evolution of adaptive divergence in fission yeast – 7 avril 2021 April 1, 2021
- Generating antibiotic resistance determinants de novo – 24 mars 2021 March 17, 2021
- Predicting expression divergence using 1000 yeast – 10 mars 2021 March 3, 2021
- Interfaces accumulate mutations which are deleterious in monomers – 24 février 2021 February 16, 2021
- The uses of structural protein readouts – 1 février 2021 February 3, 2021
Category Archives: Evolutionary genomics & Systems biology
Adaptation in conserved human proteins – 15 Novembre 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Castellano D, Uricchio LH, Munch K, Enard D, 2019. Viruses rule over adaptation in conserved human proteins bioRxiv DOI: https://doi.org/10.1101/555060 Responsable de la discussion : Anna Fijarczyk du Landry … Continue reading
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Selection on human mtDNA – 1 Novembre 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Wei W, Tuna S, Keogh MJ, Smith KR, Aitman TJ et al. Chinnery PF, 2019. Germline selection shapes human mitochondrial DNA diversity Science DOI: 10.1126/science.aau6520 Responsable de la discussion … Continue reading
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Genome shaping by transposons in a fungal pathogen – 18 Octobre
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Faino L, Seidl MF, Shi-Kunne X, Pauper M, van den Berg GCM, Wittenberg AHJ and Thomma BPHJ, 2016. Transposons passively and actively contribute to evolution of the two-speed genome … Continue reading
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What can we learn from the yeast gene-knockout collection – 4 Octobre 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Puddu F, Herzog M, Selivanova A, Wang S, Zhy J et al. Kupiec M, Jackson SP, 2019. Genome architecture and stability in the Saccharomyces cerevisiae knockout collection Nature DOI: … Continue reading
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Mutation or selection predicts genetic variation in C. elegans? – 20 septembre 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Farhadifar R, Ponciano JM, Andersen EC, Needleman DJ and Baer CF, 2016. Mutation Is a Sufficient and Robust Predictor of Genetic Variation for Mitotic Spindle Traits in Caenorhabditis elegans … Continue reading
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Designing genes resistant to horizontal gene transfer in bacteria – 6 Septembre 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Blazejewski T, Ho H-I, Wang HH, 2019. Synthetic sequence entanglement augments stability and containment of genetic information in cells Science DOI: 10.1126/science.aav5477 Responsable de la discussion : Diana Ascencio … Continue reading
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Protein physics and evolution – 9 août 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Bastolla U, Dehouck Y, Echave J. 2016 What evolution tells us about protein physics, and protein physics tells us about evolution Current opinion in structural biology DOI: 10.1016/j.sbi.2016.10.020 Responsable … Continue reading
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How spatial environment facilitates cooperation in yeast – 23 août 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Momeni B, Waite AJ, Shou W. 2013 Spatial self-organization favors heterotypic cooperation over cheating eLife DOI: 10.7554/eLife.00960 Responsable de la discussion : Lou Nielly-Thibault du Landry Lab Vendredi 23 août à … Continue reading
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Dominant subgenome in strawberry – 12 Juillet 2019
Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes Edger PP, Poorten TH, …, Knapp SJ. 2019 Origin and evolution of the octoploid strawberry genome Nature Genetics DOI: 10.1038/s41588-019-0356-4 Responsable de la discussion : Souhir Marsit du Landry … Continue reading
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Présenter ses objectifs de recherche: le test du chalk talk
Journal club InBio La présentation de nos objectifs et questions de recherche: le test du chalk talk Ce « thread » de Jordan Ward sur le fameux « chalk talk » utilisé dans certains départements américains lors des entrevues pour un poste de … Continue reading
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