Adaptation in conserved human proteins – 15 Novembre 2019

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Castellano D, Uricchio LH, Munch K, Enard D, 2019.

Viruses rule over adaptation in conserved human proteins

Responsable de la discussion :  Anna Fijarczyk du Landry Lab

Vendredi 15 novembre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/555060v1

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Selection on human mtDNA – 1 Novembre 2019

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Wei W, Tuna S, Keogh MJ, Smith KR, Aitman TJ et al. Chinnery PF, 2019.

Germline selection shapes human mitochondrial DNA diversity

Responsable de la discussion :  Damien Biot-Pelletier du Landry Lab

Vendredi 1 novembre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://science.sciencemag.org/content/364/6442/eaau6520

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Dix erreurs de statistiques courantes à éviter : – 25 octobre 2019

Journal club sur la biologie intégrative

Les auteurs ont compilé une liste des 10 erreurs statistiques les plus courantes qui apparaissent dans la littérature scientifique. Une discussion qui sera utile à tous et à toutes.

Makin et Orban de Xivry. 2019

Ten common statistical mistakes to watch out for when writing or reviewing a manuscript

https://elifesciences.org/articles/48175

 

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

Vendredi 25 octobre 2019 à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

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Genome shaping by transposons in a fungal pathogen – 18 Octobre

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Faino L, Seidl MF, Shi-Kunne X, Pauper M, van den Berg GCM, Wittenberg AHJ and Thomma BPHJ, 2016.

Transposons passively and actively contribute to evolution of the two-speed genome of a fungal pathogen

Responsable de la discussion :  Pauline Hessenauer du Landry/Hamelin Lab

Vendredi 18 octobre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://genome.cshlp.org/content/early/2016/06/20/gr.204974.116

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Implication dans l’évolution du phénotype du transfert latéral d’un gène de virus : – 11 octobre 2019

Journal club sur la biologie intégrative

Les pucerons peuvent avoir des ailes ou non et cette variation du phénotype est plastique et liée à la densité. La capacité à répondre de façon plastique à la densité de congénère varie entre les génotypes et ceci serait dû à l’activité d’un gène viral inséré dans le génome du puceron par transfert latéral de gène.

Parker and Brisson. 2019

A laterally transferred Viral Gene Modifies Aphid Wing Plasticity

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960982219306116

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

Vendredi 11 octobre 2019 à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

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What can we learn from the yeast gene-knockout collection – 4 Octobre 2019

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Puddu F, Herzog M, Selivanova A, Wang S, Zhy J et al. Kupiec M, Jackson SP, 2019.

Genome architecture and stability in the Saccharomyces cerevisiae knockout collection

Responsable de la discussion :  Johan Hallin du Landry Lab

Vendredi 4 octobre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://www.nature.com/articles/s41586-019-1549-9

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Mutation or selection predicts genetic variation in C. elegans? – 20 septembre 2019

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Farhadifar R, Ponciano JM, Andersen EC, Needleman DJ and Baer CF, 2016.

Mutation Is a Sufficient and Robust Predictor of Genetic Variation for Mitotic Spindle Traits in Caenorhabditis elegans

Responsable de la discussion :  Mathieu Hénault du Landry Lab

Vendredi 20 septembre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://www.genetics.org/content/203/4/1859

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Le chat sort du sac : comment un parasite reconnait ses hôtes – 13 septembre 2019

Journal club sur la biologie intégrative

Toxoplasma infecte un rongeur et se reproduit ensuite dans son prédateur, le chat. Comment un parasite avec plusieurs hôtes arrivent t’il à les distinguer? Si on manipule le signal et qu’on “félinise” le rongeur, est-ce que Toxoplasma le prendra pour un chat?

Martorelli Di Genova et al. 2019

Intestinal delta-6-desaturase activity determines host range for Toxoplasma sexual reproduction

 

https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000364

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

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Designing genes resistant to horizontal gene transfer in bacteria – 6 Septembre 2019

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Blazejewski T, Ho H-I, Wang HH, 2019.

Synthetic sequence entanglement augments stability and containment of genetic information in cells

Responsable de la discussion :  Diana Ascencio du Landry Lab

Vendredi 6 septembre à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://science.sciencemag.org/content/365/6453/595

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Adaptation et variations du nombre de copies de gènes – 30 août 2019

Journal club sur la biologie intégrative

L’adaptation après la colonisation d’un nouvel environnement et les variations du nombre de copies de gènes

Ishikawa et al. 2019

A key metabolic gene for recurrent freshwater colonization and radiation in fishes

https://science.sciencemag.org/content/364/6443/886.abstract

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

Vendredi 30 août 2019 à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

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