Le génome humain exprime les allèles néandertaliens différemment de ceux de l’Homo sapiens ancestral – 11 août 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

McCoy RC, Wakefield J et Akey JM. 2017.

Impacts of Neanderthal-Introgressed Sequences on the Landscape of Human Gene Expression

Cell. 168(5):916-927

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Responsable de la discussion : Chris Eberlein du laboratoire Landry

Vendredi 11 août à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.cell.com/fulltext/S0092-8674%2817%2930128-9

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Intégrer la phylogénie, le génome et le transcriptome pour inférer les réseaux de régulation – 28 juillet 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Koch C, Konieczka J, Delorey T, Lyons A, Socha A, Davis K, Knaack SA, Thompson D, O’Shea EK, Regev A et Roy S. 2017.

Inference and Evolutionary Analysis of Genome-Scale Regulatory Networks in Large Phylogenies

Cell Systems. 4(5):543-558

NetworkPhylogeny

Responsable de la discussion : Mathieu Hénault du laboratoire Landry

Vendredi 28 juillet à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(17)30178-3

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Effets de la corégulation des paralogues sur leur subfonctionalisation chez les mammifères – 16 juin 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Lan X et Pritchard JK. 2016.

Coregulation of tandem duplicate genes slows evolution of subfunctionalization in mammals

Science. 352(6288):1009-1013

DupFate

Responsable de la discussion : Claudine Lamothe du laboratoire Landry

Vendredi 16 juin à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://science.sciencemag.org.acces.bibl.ulaval.ca/content/352/6288/1009

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Une approche microfluidique pour la génomique/sécrétomique de cellules uniques et les interactions cellule-cellule – 2 juin 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Terekhov SS, … et Altman S. 2017.

Microfluidic droplet platform for ultrahigh-throughput single-cell screening of biodiversity

PNAS. 114(10):2550-2555

Microfluidics

Responsable de la discussion : Guillaume Nguyen du laboratoire Landry

Vendredi 2 juin à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.pnas.org/content/114/10/2550.full

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Le flux génique permet de définir les espèces biologiques, même sans reproduction sexuée – 19 mai 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Bobay LM et Ochman H. 2017.

Biological Species Are Universal across Life’s Domains

Genome Biology and Evolution. 9(3):491-501

Species

Responsable de la discussion : Guillaume Charron du laboratoire Landry

Vendredi 19 mai à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://academic.oup.com/gbe/article-lookup/doi/10.1093/gbe/evx026

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Les céphalopodes éditent leur ARN, surtout dans le cerveau – 12 mai 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Liscovitch-Brauer et al. 2017

Trade-off between Transcriptome Plasticity and Genome Evolution in Cephalopods

Cell 169 : 191-202

Liscovitch-Brauer_etal_fig1

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

Vendredi 12 mai à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(17)30344-6

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Éléments transposables et dynamique de la taille des génomes – 5 mai 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Kapusta A, Suh A et Feschotte C. 2017.

Dynamics of genome size evolution in birds and mammals

PNAS. 114(8):E1460-E1469

GenomeSize

Responsable de la discussion : Anna Fijarczyk du laboratoire Landry

Vendredi 5 mai à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.pnas.org/content/114/8/E1460.abstract

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Le transfert horizontal de gènes entre les vertébrés serait-il plus fréquent qu’on le pense? – 21 avril 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Huang W, Tsai L, Li Y, Hua N , Sun C et Wei C. 2017.

Widespread of horizontal gene transfer in the human genome

BMC Genomics. 18:274

HorribleTrees

Responsable de la discussion : Véronique Hamel du laboratoire Landry

Vendredi 21 avril à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3649-y

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Qu’est-ce qui rend les tardigrades invincibles – 31 mars 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Boothby et al. 2017

Tardigrades Use Intrinsically Disordered Proteins to Survive Desiccation

 

Molecular cell 65 : 975-984

Boothby_etal_2017_fig1

Responsable de la discussion: Christian Landry

Vendredi 31 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

 http://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(17)30133-8

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Hétérosis et bouleversement régulatoire chez une levure hybride – 24 mars 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Herbst RH, Bar-Zvi D, Pines G, Reikhav S , Soifer I, Breker M, Jona G, Shimoni E, Schuldiner M, Levy A et Barkai N. 2017.

Large-scale rewiring in a yeast hybrid

bioRxiv. doi: http://dx.doi.org/10.1101/100263

Hybrid

Responsable de la discussion: Souhir Marsit du laboratoire Landry

Vendredi 24 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://biorxiv.org/content/early/2017/01/13/100263

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