Le transfert horizontal de gènes entre les vertébrés serait-il plus fréquent qu’on le pense? – 21 avril 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Huang W, Tsai L, Li Y, Hua N , Sun C et Wei C. 2017.

Widespread of horizontal gene transfer in the human genome

BMC Genomics. 18:274

HorribleTrees

Responsable de la discussion : Véronique Hamel du laboratoire Landry

Vendredi 21 avril à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3649-y

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Qu’est-ce qui rend les tardigrades invincibles – 31 mars 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Boothby et al. 2017

Tardigrades Use Intrinsically Disordered Proteins to Survive Desiccation

 

Molecular cell 65 : 975-984

Boothby_etal_2017_fig1

Responsable de la discussion: Christian Landry

Vendredi 31 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

 http://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(17)30133-8

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Hétérosis et bouleversement régulatoire chez une levure hybride – 24 mars 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Herbst RH, Bar-Zvi D, Pines G, Reikhav S , Soifer I, Breker M, Jona G, Shimoni E, Schuldiner M, Levy A et Barkai N. 2017.

Large-scale rewiring in a yeast hybrid

bioRxiv. doi: http://dx.doi.org/10.1101/100263

Hybrid

Responsable de la discussion: Souhir Marsit du laboratoire Landry

Vendredi 24 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://biorxiv.org/content/early/2017/01/13/100263

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Test expérimental d’une adaptation moléculaire – 17 mars 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Siddiq et al. 2017

Experimental test and refutation of a classic case of molecular adaptation in Drosophila melanogaster

Nature Ecology & Evolution 1 : 0025

Siddiq_etal2017fig2

Responsable de la discussion: labo Aubin-Horth

Vendredi 17 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.nature.com/articles/s41559-016-0025

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Les exosomes comme canal de communication entre un parasite et son hôte – 3 mars 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Hassani et al. 2014

Absence of Metalloprotease GP63 Alters the Protein Content of Leishmania Exosomes

PLoS ONE 9 : e95007

Hassani_etal_2014_fig5

Responsable de la discussion: labo Aubin-Horth

Vendredi 3 mars à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0095007

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Modifications génomiques parallèles et retraçables avec CRISPR-Cas9 – 24 fév. 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Garst AD, Bassalo MC, Pines G, Lynch SA , Halweg-Edwards AL, Liu R, Liang L, Wang Z, Zeitoun R, Alexander WG et Gill RT. 2016.

Genome-wide mapping of mutations at single-nucleotide resolution for protein, metabolic and genome engineering

Nature Biotechnology. 35: 48-55.

Engineering

Responsable de la discussion: Philippe Després du laboratoire Landry

Vendredi 24 février à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.nature.com/nbt/journal/v35/n1/full/nbt.3718.html

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Co-évolution entre un parasite et son hôte – 17 février 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Weber et al. 2017

Resist Globally, Infect Locally: A Transcontinental Test of Adaptation by Stickleback and Their Tapeworm Parasite

American Naturalist. 189 : 43-57

 Weber_etal_fig4

Responsable de la discussion: labo Aubin-Horth

Vendredi 17 février à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.journals.uchicago.edu/doi/pdfplus/10.1086/689597

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La coexpression des gènes doit-elle servir à leur annotation? – 10 fév. 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Uygun S, Peng C, Lehti-Shiu MD, Last RL et Shiu SH. 2016.

Utility and Limitations of Using Gene Expression Data to Identify Functional Associations

PLOS Computational Biology. 12(12): e1005244.

Coexpression

Responsable de la discussion: Nadia Aubin-Horth

Vendredi 10 février à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1005244

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Évolution de la structure et de l’expression d’un génome de grenouille allotétraploïde – 27 jan. 2017

Journal club sur la génomique évolutive et la biologie des systèmes

Session AM, (beaucoup d’autres) et Rokhsar DS. 2016.

Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis

Nature. 538: 336-343.

allotetraploid

Responsable de la discussion: Ben Sutherland du labo Bernatchez

Vendredi 27 janvier à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7625/abs/nature19840.html

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Est-ce que le stress peut causer l’extinction d’une population? – 20 janv 2017

Journal club sur la biologie intégrative

Amorim et al. 2017

Does long term low impact stress cause population extinction? 

Environmental pollution 220: 1014-1023.

Amorim_etal_fig

Responsable de la discussion: Caroline Côté du labo Aubin-Horth

Vendredi 20 janvier à 11h30, 3225 Pavillon Marchand

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0269749116322291

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